Все хонорификсы употребляются после фамилии, имени, прозвища или звания. Присоединяются к слову, обозначающему третье лицо либо собеседника (именно так, а не "второе лицо". Причина - в японском языке к собеседнику чаще всего обращаются через третье лицо) в разговоре, и несут в себе определенную смысловую нагрузку, к примеру, обозначая уровень почтительности. Стоит помнить, что кэйсё может присоединяться не только к имени или фамилии, но также и к профессии, к статусу, и т.д. К местоимениям не присоединяется. Употреблять его по отношению к себе - демонстрация либо невежества, либо инфантильности, либо и того, и другого вместе (например: здравствуйте, я Ямада-сан), кроме тех случаев когда мать при разговоре с ребенком называет себя 母さん(okaa-san, мама).
Выбор хонорификса определяется характером говорящего (нормальный, грубый, очень вежливый), его отношением к слушателю (обычная вежливость, уважение, заискивание, грубость, высокомерие), их положением в обществе и ситуацией, в которой происходит беседа (один на один, в кругу близких друзей, между коллегами, между незнакомыми людьми, на людях).

Сан さん (san) - аналогичен английскому "Mr.", "Mrs.", и "Ms.". Чаще всего присоединяется к имени или фамилии. Стоит заметить, что обращение по фамилии для японца привычнее. Уровень вежливости - нейтральный. На "-сан" можно обращаться в подавляющем большинстве случаев. Так обращается преподаватель к студентам, поверхностно знакомые или незнакомые люди друг к другу, словом в тех случаях, когда отношения с собеседником не требуют выражать фамильярность или почтение, только нейтральную вежливость.
"-сан" может присоединяться к месту работы, особенно если это касается сферы обслуживания и/или торговли. Пример: "хонъя" - книжный магазин, "хонъя-сан" - продавец. ОДНАКО! В регионе Кансай "-сан" может присоединятся ко многим существительным (особенность диалекта). Например, если в остальных регионах "хонъя-сан" - обращение к продавцу книжного магазина, в Кансае это может быть просто "книжный магазин". А "-сан" - для пущей красоты. Ежедневная фраза "Доброе утро" стандартно звучит "Охайёгодзаимас", но в Кансае - "Охайё-сан!". И так далее. Также некоторые прибавляют "-сан" к животным и продуктам питания, это чаще всего произносится преувеличенно "детским" тоном, и воспринимается как незрелая, детская, показательно-каваийная речь.

Хан はん (han) - Кансайский диалектный аналог "сан".

Сенсей 先生 (せんせい, sensei) - полноценная самостоятельная лексическая единица. Означает - "учитель, наставник". Можно употреблять "сэнсэй" в качестве обращения, а можно присоединять его к фамилии. "Сэнсэй" можно и нужно обращаться не только к своему преподавателю. Это вполне официальное обращение к врачам, адвокатам, политикам и другим представителям власти, а также признание того, что адресат является мастером в каком-либо искусстве. К примеру, мастеров единоборств, чайной церемонии, каллиграфии и т.д. вежливо назвать сэнсэями, даже если они не преподают свое искусство. Фаны манга называют сэнсэями мангак, фаны определенных писателей, композиторов и музыкантов также часто называют своих кумиров на "-сэнсэй". Сторонники определенных политических, экономических и религиозных сил как правило называют лидеров на "-сэнсэй", и это закономерно воспринимается как подхалимаж (особенно если обращающийся не принадлежит к этой фракции).
Например:
わたなべ先生 (Watanabesensei) - учитель Ватанабэ

Шишо (shishou) – не очень уверена в этом хонорификсе, но вероятнее всего, означает наставника. Так часто обращается Сакура к Цунаде и Кеншин к Хико.

Семпай 先輩 (せんぱい, sempai) – употребляется, например, при обращении ученика начальных классов к старшекласснику, новичком на работе к более опытному сотруднику и т.д.
буквальный перевод – старший товарищ

Ко:хай 後輩 (んこうはい, kouhai) - Тоже что и семпай, только при обращении к младшему. (Двоеточие в о: показывает долгий звук «о».)

Кун 君 (くん, kun) - применяется в речи с(о) молодым мужчиной, младше говорящего по возрасту, с мужчиной средних лет, если он старый знакомый или однокашник говорящего. Также くん можно применить по отношению к молодой женщине, если она служит в фирме под начальством говорящего. Например, Ирука при обращении к Сакуре использует «кун». По отношению к совершеннолетним мужчинам "-кун" употребляется при определенной степени фамильярности. К примеру, назвать так человека, с которым только что познакомился - довольно грубо.
По отношению к девочке/женщине тоже иногда возможно употребить "-кун". Чаще всего так обращаются мужчины в возрасте к младшей и по возрасту и по статусу коллеге. Иногда и просто к коллеге, независимо от возраста и статуса. Либо друг мужского пола по отношению к подруге, если кэйсё "-сан" уже слишком вежливо-холодное, а "-тян" неуместно. Такое обращение в меру демократично, и не излишне фамильярно, а посему оно завоевывает популярность. Иногда так зовут девочки друг друга, либо дабы продемонстрировать свою "крутость", либо если их по каким-то причинам не устраивает "-сан" и "-тян".
По аналогии со сценическими кличками звезд, фотомоделей из молодежных журналов, преимущественно мужских, традиционно называют на "-кун".
И напоследок - в японском Парламенте депутаты называют друг друга на "-кун" всегда, независимо от возраста и прочих факторов, причем присоединяют к имени и фамилии вместе (Абэ Синдзо-кун). Единственное исключение за всю историю - когда спикером нижней палаты была Такако Дои.
Например:
エクセルくん(Ekuseru-kun) – эксель кун

Пён ぴょん (pyon) - Детский вариант "кун".

Ччи っち (cchi) - Детский вариант “чан" (ср. "Тамагоччи").

Ян やん (yan) - Кансайский диалектный аналог "чан" и "кун".

Сама 様 (さま) (sama) - крайне почтительный аналог хонорификса “сан”. Используется как в письменной, так и в устной речи. С его помощью обращаются работники сферы обслуживания к клиентам, чтобы продемонстрировать свое почтение. "Ками-сама" 神さま(kamisama) - бог (не только христианский), "О-кяку-сама" - "господин клиент", "-сама" всегда присоединяется к именам членов императорской семьи, как правило присоединяется к имени адресата в письмах, независимо от степени близости, часто его присоединяют фанаты к имени своего кумира ("Лео-сама" даже в свое время стал официальным газетным прозвищем Лео ДиКаприо).
"-сама" используется в ряде устойчивых фраз. Например "Готисоо-сама" (Благодарю за угощение), "Гокуроо-сама" (Благодарю за ваш нелегкий труд). Однако очевидно, что кэйсё "-сама" и такое употребление его имеют разную природу, и не стоит их путать.

Тяма (тама) - совмещённые -тян и -сама. В русском языке может соответствовать чему-то вроде «маленькая госпожа» (в мужском роде употребляется крайне редко). С помощью "тяма" иногда обращаются к старикам, чтобы одновременно продемонстрировать теплые отношения и почтение. "Тама" - самое детское, например "Онии-тама" (Старший братец).

Доно 殿 (どの, dono) - Редкий хонорификс. Уважительное обращение к равному или высшему, но незначительно отличающемуся по положению. В настоящее время считается устаревшим и практически не встречается в общении. В древности активно использовался при обращении самураев друг к другу. Первое значение - "Милорд", "Господин". В свое время являлось традиционным хонорификсом для аристократии. Используется в письменной речи, преимущественно в деловой переписке, а также в сертификатах, дипломах, грамотах, наградных листах. Также может использоваться для обозначения старших по званию, например "начальник отдела Фукухара-доно".
Например:
大佐殿 (taisa-dono) господин полковник
В «Наруто» Дейдара обращается к Сасори, используя хонорификс «данна». Этот хорификс устаревшая форма «доно». Более официален, чем «сан», но менее официален, чем «сама».

Какка 閣下 (かっか, kakka) - употребляется в основном к руководящему составу страны, например к министрам
Например:
首相閣下(syasyou-kakka) - его(Ваше) превосходительство г-н премьер-министр

Ши 氏し (shi) - "Господин", используется в публицистическом и официально-деловом стиле речи. То есть либо в письменной речи либо в официальных выступлениях. Зачастую означает, что человек лично не знаком говорящему, как правило употребляется при ссылке на чьи-либо слова, публикации, труды. К примеру, если я в дипломе ссылаюсь на ученого-филолога Токиэда Мотоки, то несмотря на всю глубину моего к нему уважения, немогу назвать его на "-сама" или "-доно", а обязана употреблять его имя именно с этим кэйсё. Это кэйсё стандартно для газет, выпусков новостей, документов, научного стиля и т.д. и т.п.
В древности иероглиф "ши" читался как "уджи", и дал фамилию знаменитому клану аристократов Камоуджи. Что интересно, в отличие от других кэйсё, "-ши" можно употреблять самостоятельно после первой ссылки на персону. То есть в реферате пишем один раз "Токиэда-ши", и когда речь дальше пойдет о нем, именуем его просто "ши", и так пока не попадется другое имя с тем же кэйсё.

Фуджин 夫人 (ふじん, fujin) - "Госпожа", используется исключительно в официальных документах после фамилии.

Уе うえ (ue) - "Старший". Редкий и устаревший уважительный суффикс, использующийся по отношению к старшим членам семьи. Не используется с именами - только с обозначениями положения в семье ("отец", "мать", "брат").

Дзин (jin) - "Один из". "Сая-дзин" - "один из Сая".

Гуми (gumi) - "Команда, группа, тусовка". "Кеншин-гуми" - "Команда Кеншина".

В семье обращаются друг к другу не по именам, а используя термины родства:

ни:-сан (старший брат, допустимы суффиксы чанн, сама),
нэ:-сан (чан, сама; старшая сестра).
Младших членов семьи по терминам родства не именуют, используют суффикс чан. К матери обращаются ока:-сан, к отцу - ото:-сан, к бабушке - оба:-сан, к дедушке - оджи:-сан, тете - оба-сан, дяде - оджи-сан. (Двоеточие, как помните, означает удлиненный звук.)
Когда жена обращается к мужу, она использует хонорификсы сан или сама. Муж к жене обращается, используя хонорификсы чан или сан, к детям - чан (девочки) или кун (мальчики). К жене после рождения детей муж обращается ка:-сан. В официальном стиле речи используются так же такие хонорификсы как -ши, в отношении и женщин, и мужчин, дзёси - госпожа.
Может употребляться уважительный префикс «о-».

В роли хонорификса может употребляться также профессия. Например, в масс-медиа футболиста Накату скорее назовут Наката-сэнсю (сэнсю=спортсмен), чем Наката-сан. Известного плотника Судзуки могут назвать Судзуки-торё: (плотник), а адвоката Маруяму - Маруяма-бэнгоши (бэнгоши=адвокат), но при этом в личном разговоре к ним обратятся с помощью хонорификса "-сэнсэй". На фирме традиционно обращение через пост, директора компании назовут что в личном разговоре, что за глаза "сятё:", либо фамилия+сятё:,
начальника отдела соответственно катё: либо фамилия+катё: и т.д.

Сэнсю 選手 (せんしゅ, senshu) - "Спортсмен". Используется по отношению к спортсменам.

Дзеки ぜき (zeki) - "Борец сумо". Используется по отношению к сумоистам.

Йокодзуна 横綱 (よこずな yokozuna) - высший титул в борьбе сумо

При обозначении представителя профессии в японском языке часто к корню слова, обозначающего профессию, цепляют второй корень, обозначающий персону. И здесь есть свой нюанс. Ибо среди корней, обозначающих персону, есть два почти взамозаменяемых - "-ша" и "-ка", из них "-ка" более уважительно. Пример: берем слово хонъяку (письменный перевод). Цепляем суффикс, получаем два слова для обозначения переводчика - хонъякушу и хонъякука. Так как "-ка" более уважительно, о себе сказать "ваташи ва хонъякука дэсу" (я - переводчик) нельзя. О себе мы говорим "хонъякуша". И если речь идет не о конкретном представителе профессии, которого мы уважаем - тоже говорим "хонъякуша". А вот в разговоре мы спросим "Танака-сан ва хонъякука дэсё: ка" (Господин Танака, вы видимо переводчик?).

По отношению к преступникам также есть специальные хонорификсы. Раньше их не было, преступников называли без кэйсё вовсе, но в последнее время из-за политкорректности было решено их ввести. Подозреваемого называют через "ё:гиша", подсудимого - через "хикоку", отбывающего наказание - через "джукэйша". Например: "Мацумото-хикоку из секты Аум Шинрикё". Из-за того, что эти слова используются как хонорификсы, они утратили свою первоначальную нейтральность и обрели некий уничижительный флёр.

По отношению к аристократам, дипломатам и прочим употребляют такие хонорификсы, как "хэйка" (Величество: Тэнно:хэйка - Его Величество Император, Ко:го:хэйка - Ее Величество Императрица, Кокуо:хэйка - Его Величество Король,Дзёо:хэйка - Ее Величество Королева), "дэнка" (Высочество: Диана-ко:тайси-дэнка - Ее Высочество принцесса Диана), "какка" (Ваше Превосходительство - по отношению к послам и главам государств), "хидэнка" по отношению к консортам. Премьер-министров же обычно называют "сюсё:". Обладающего высоким рангом в религиозной конфессии называют "сэйка" - Его Преосвященство. Главу (Далай-Ламу или Папу) - "гэйка" - Его Святейшество. Причем православного архиепископа или патриарха скорее назовут "дзака". Настоятелей или аббатов назовут "дайка". Святого - "сэй", причем это префикс. То есть святой Иоганн = Сэй-Ёханэ.
Старшего сына в семье могут назвать хонкэ - глава семьи.
К министру так же можно - дайдзин, так же можно прибавив название ведомства.
К послу - тайси, "господин посол", посланник.
К губернатору - тидзи,"господин губернатор".
К мэру - ситё:, господин мэр.
Обозначения клана, рода - си, дзоку.

В спортивном мире свои правила. В зависимости от статуса мастера могут назвать рэнси (инструктор), кё:си (учитель), ханси (учитель учителей) и т.д. Тренера сумо часто называют ояката. Но разбираться в их титулах человеку, с миром спорта не связанному - почти непосильная задача.

Хонорификсами также являются воинские звания и должности, но это отдельная и весьма длинная категория))

Еще есть такие женские уважительные хонорификсы как "дзёси" и "тодзи", по отношению к замужней женщине - "фудзин", а по отношению к незамужней девушке еще и "дзё:". С эпохи Хэйан по эпоху Эдо часто по отношению к аристократическим семьям употребляли хонорификсы "кё:" и "ко:". В эпистолярном жанре к названию организации, к которой принадлежит адресат, порой цепляют хонорификсы "онтю:". Буддисты называют объект своей веры с помощью хонорификса "сон", а самого Сиддтхартху Гаутаму - "сякусон". По отношению ко многим собеседникам можно употребить множественный суффикс "какуи" вместо привычного "мина-сан". Придворные могут назвать императора "сюдзё:" или "сэйдзё:". По отношению к сыну почитаемого человека можно сказать "рэйсоку", а к дочери - "рэйдзё:". Японский аналог "товарища" и "камрада" - "до:си" (буквально по иероглифам - одинаковые намерения). В письменном стиле речи коллегу-мужчину (если он не сэмпай) можно назвать "кика".

Немного истории

Суффикс химэ(-hime). Добавлялся к фамилиям девушек из благородных семей и имеел лексическое значение "принцесса, дочь солнца". По этой причине он часто выходил в состав женскимх имен (все дружно вспоминаем Орихиме из Bleach). Использовался для подчеркивания благородного происхождения девушки или ее высокого положения.

Для имён жён самураев использовался суффикс «-годзэн». Часто их называли просто по фамилии и званию мужа. Личные имена замужних женщин практически использовались только их близкими родственниками.

Для имён монахов и монахинь из благородных сословий использовался суффикс «-ин».

Суффиксы «-ва», «-мо», которые можно услышать после имени или местоимения «я» (ваташи) являются падежными для всех существительных. Так что развею ваши сомнения - они не являются хонорификсами.